乌龙寺住持圆慧以及珍贵的《九阴真经》无故失踪,之后,圆慧的胞弟紫微真人(王华 饰)成为了当朝国师。小和尚开心(曹骏 饰)被调至乌龙寺担当住持,阴差阳错之下认了平日里四处招惹是非的小混混百搭(陈天文 饰)做他的师叔,两人捣鼓出的动静常常将寺中掌管戒律的铁空气得半死。当今皇帝昏庸无能,手握大权的紫微真人企图谋权篡位,深受其害的皇后为了终结国师的阴谋,秘密派出宫女梅香去乌龙寺找开心,寻求他的帮助。然而,当开心抵达京城之时,紫薇真人早已得势,一手遮天,而单纯善良的开心则在无意之中中了国师的奸计,身负重伤。
抗战胜利前夕,潜伏在军统的中共地下党员欧孝安(黄景瑜 饰)从日军生化毒气研究所监狱中成功越狱,途中受重伤昏迷,被中国远征军发现并救走。苏醒后的欧孝安发现自己丧失了在监狱近四年的记忆。欧孝安以四年前记忆的终点为起点,捡拾零星记忆,秘密调查并意图揭露日本间谍黎少堂(马思超 饰)的罪恶嘴脸。期间,他与中共地下党员覃墨卿(辛芷蕾 饰)从相互质疑、试探,到联手合作,找到了日军生化毒气研究所,抓获了日军情报司令长官大桥和野。抗战胜利后,国民党准备全盘接收日军生化毒气研究所遗留的“人、财、物”,为日后与中共作战做准备。欧孝安获悉了这个情报并粉碎了这个恶毒计划,同时揭露了黎少堂日本间谍的真面目,在中共地下党内代号为“孤星”的欧孝安终于回到了党组织的怀抱。