《万古神帝》改编自阅文白金作家飞天鱼的同名小说。 八百年前，张若尘身为明帝独子，天资绝世却遭青梅竹马的池瑶公主斩杀；八百年后，他重生在云武郡国的废柴九王子“张若尘”体内，这具身体体弱多病、毫无灵力，与母亲林妃在郡王府备受欺凌。觉醒记忆后，张若尘立誓向已是昆仑界主宰的池瑶女皇复仇，同时守护给予他母爱的林妃。他觉醒时空神武印记，凭前世经验和努力快速成长，岁末考核夺冠后，历经武市斗场厮杀、地府门截杀，进入武市学宫深造。
人类世界之外，藏着神秘而美好的叶罗丽仙境。这里的仙子因自然与人类世界的兴衰而生，也与万物命运相连。当人类世界灾难骤起，风云失色，失衡的力量逐渐波及仙境。危机之中，人类与仙子重新理解彼此，为守护两个世界共同的未来，倾尽所有，并肩而战。
200年前，超元世界的人类和来自其他世界的怪兽发生了战争。为了对抗强大的怪兽，人类发明了超元卡装置，将怪兽封印在超元卡中，结束了战争。主人公云天曾是一位热爱超元卡比赛的少年，但是体质特殊的他无法控制好超元卡中的怪兽能量。一天，他意外从爸爸发掘的古遗迹中获得了一个神奇的卡盒。云天决定前往寻找4张传说超元卡，希望用向超元卡许愿的方式找回哥哥。就这样，云天告别了父母，踏上旅程
主角樊凌霄是凌霄阁少年掌门，将一条小鲇鱼进化成了吞天噬地的灵鲲，名震天下。但在一次对决中灵鲲进化失败，竟然弑主。因为夺舍涅槃的能力，一年后樊凌霄占据他人身体再次苏醒，凌霄阁因为掌门的死亡渐渐破败了，这一次他和他的灵鲲再次带领凌霄阁走向巅峰！
