《幕后真凶》是一部以缉毒警察为题材的案件悬疑剧，剧情跨越了20多年，讲述了两代缉毒警察的故事。 三十多年前，在松江土地上发生了一起生物制剂非法出境案，随着此案的发生，缉毒刑警计春生失踪，卧底警察楚江河生死不明，而作为案件核心的CH型生物试剂不翼而飞，此案成了一桩悬案。 而就在二十多年后的现在，当年的缉毒支队成员高平率领着楚江河的儿子楚白以及一众干警势要查清当年的真相，化工广场大爆炸、四名被绑架的孩子、同一时间互相杀人的死者、摩天轮焚尸等一系列奇案的发生让真相逐渐浮出水面，但随着接近真相，一直藏在暗中的那双手使这桩跨越二十余年的大案更加扑朔迷离起来，随着刑警米乐儿的失踪，众人这才意识到，藏在黑暗背后的那双手，竟然是“他”！最终，这个尘封20年的大案终于侦破，而背后的真正元凶却是谁也未曾猜想到的。 可无论如何，楚白完成了自己的梦想，为当年卧底的父亲正名，...
罗志祥（寇振海 饰）是一家国企的老总，膝下有一双女儿，长女罗柔（陈紫函 饰）骄蛮专橫，凡事不让人。小女罗一（呂一 饰）由于是抱养的，自幼失聪，所以罗志祥夫妻俩对她更加关爱。罗柔感觉应属于自己的爱被罗一分享，连妹妺与闻杰（贾乃亮 饰）相爱，她都从中作梗。她自认闻杰应该属于自己，逼罗一嫁给心怀不轨的许世霖（赵毅 饰）。因公司内部小人作祟，罗家败落了，母亲和父亲先后离开人世，失去双亲的罗家姐妹一时间陷入感情与生活的低谷。就在这时姑妈（朱琳 饰）的出现揭开了罗一不为人知的身世，原来她才是罗一的生母。知道真相的罗柔为窃取公司财产，不择手段地向妹妹抛来了另一张充满阴谋的大网......
卧底警察何楠潜伏在云天集团内部，任务是搜寻云天集团董事长朱德福非法集资的罪证。就在何楠获得线索同时，被朱德福发现，并将一起杀人命案嫁祸于何楠，使何楠成为警方通缉的逃犯。朱德福儿子朱子杰的女朋友周丽，替朱子杰顶罪坐了五年牢，就在她出狱以后，发现朱子杰与富家千金宋思琪订婚。周丽心灰意冷。同时，朱德福为了能让儿子和宋思琪的婚事不受干扰，从而达到让宋家给云天集团注资的目的，他派出杀手追杀周丽。何楠和周丽同样遭遇到朱德福集团的追杀，两人就此联手，一同踏上破解朱德福罪证线索的危险旅程。
