故事时间为战国时代，世上具有各种魑魅魍魉、异形妖怪等等总称为「暗」的存在。喜欢人类的暗·妖狐小玉，以及厌恶人类的仙道·迅火，姊弟两人进行著扫荡罪恶的救世活动。另外还有一群专门对付暗的僧侣·断怪众，他们以不人道的方式进行人体改造，迅火等人与他们产生激烈冲突！人类当中也有坏人，非人类的存在也不见得都是邪恶的，迅火因过去的事而极其讨厌人类，但在旅程当中，也逐渐目睹到人类善良的一面，他是否能有所转变呢……
“维斯顿井”是位于海洋与陆地之间的一个异世界。那是一个深海与天空共存的世界，以地热和人的“灵气之力”为源头，甚至妖精费拉里奥与黑暗混沌共存。 A国的地方领主德雷克·拉夫特为了增强军事实力，试图吸引拥有强大气场的地表人类。其中一人，翔扎马，被授予灵气战士丹拜因，并被视为圣战士。然而，当他遇见叛逆者尼伊·吉文和他的追随者，地球女孩玛维尔·弗罗兹时，他面对了一些令人费解的话语。 “一个什么都不知道却帮助德雷克的愚蠢男人。”最终，“维斯顿之井”的冲突发展成为一团巨大的战争阴云，并席卷了地面世界。
8月12日，灼热的京都左京区。“下鸭幽水庄”唯一的空调不开了。坏朋友小津昨晚把遥控器给淹了。正当“我”和电影社团“みそぎ”的冷酷美人明石商量对策时，出现了一个长相木讷、素不相识的男学生·田村。据说他是乘坐时光机从25年后的未来过来的。就在这时，“我”突然灵光一闪。用这个时间机器回到昨天，拿起坏掉之前的遥控器不就行了吗！但是，小津他们随心所欲地改变昨天，改写过去。预感到世界毁灭危机的“我”，慌忙介入阻止，不过，已经晚了!最后，遥控器和日常生活能平安回来吗！？以及，“我”和明石的恋爱去向是——?在“昨天”与“今天”之间，放眼世界稀里糊涂胡乱使用时间机器的故事，开始了！
