東京奪還編、開戦。 謎の少年?スティグマ率いる“アマラリルク”との戦いを経て少し成長したシャイ。 日本に戻ってきた彼女が出会ったのは、忍者の里から家出中という少女?天王寺曖だった。 彼女は“アマラリルク”の一員を追って里を出てきたとシャイに告げる。 そんな中、東京が突如黒球に包まれて消失する事件が発生。ヒーローたちは東京を救出するため出動するーー。
屯田林宪三郎，一名有妻有女、还有点宅的52岁公务员。某天，他在路上为了拯救小孩而被卡车撞到，失去意识，醒来时发现自己变成了金发纵卷的公爵千金·格蕾丝．奥弗涅的模样！看来自己成为了女儿在玩的女性向游戏《魔法学园爱＆魔兽》里登场的“反派千金”，宪三郎理解到自己遭遇到所谓的异世界转生。在那样的格蕾丝＝宪三郎的面前，游戏原本的主角安娜出现了……！？
本次公开的第二季动画标题为《我的妹妹哪有这么可爱。》，乍看之下似乎与第一季没什么区别，其实区别就在于最后的一个“。”句号。本次有意将第一季标题加上句号作为第二季的标题，不得不令人联想第二季是否意味着真正完结？
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！
目前仍在月刊「Comic Gum」上热载中的热血格斗漫画《一骑当千》，其故事主线与中国一千八百年前的三国时代相关，并且曾两度被改编成TV动画，作为前作《一骑当千 Dragon Destiny》的最新续作《一骑当千 Great Guardians》，将于2008年7月亮相，并预定从6月11日起在AT-X上先行播放，其中「孙权仲谋」将作为孙策伯符的妹妹在动画第三季中的原创新人物登场，就连吕布奉先都将在第三季度中复活！山中雷鸣响彻，地面突然突起异物。
