2020年，网络对于如今人们的生活而言已经是不可或缺的一部分。但是，人类所不知道的是，在网络的另一面有着一个无限的世界——数码世界，以及居住在其中的数码兽……以首都圈为中心发生了大规模网络故障，乱闪的信号灯、乱码的室外屏幕……新闻上报道是网络恐怖袭击。故事的主人公是住在东京近郊高层公寓的小学五年级生八神太一。为了准备周末的夏令营而一个人留在家中，去涩谷的母亲和妹妹八神光乘上了一辆无法停止的电车。为了救母亲和妹妹，太一急忙赶往涩谷，当他前往车站月台的瞬间发生了不可思议的现象，太一去了数码世界！孩子们与搭档数码兽相遇，一同面对未知的“冒险”！
1910年代，由大日本帝国陆军设立的学校——陆军栖凤中学。这是一个为获取可用于军事的超常力量而收集、研究超自然现象的特殊机构。栖凤中学三年级学生岩元胡堂奉军部指令，奔赴全国各地进行调查。然而他所到之处。
日本国中女生铃木夕梨被咒术牵引至纪元前的赫梯帝国，并长期遭受娜姬雅王后的追杀，目的在于以她为祭品咒杀凯鲁王子。在凯鲁的庇护与指导下，夕梨从误打误撞开始学习成长，到最后能够与王太后在政治舞台上一较高下，其强大的行动力以及敏锐卓越的决策能力，被凯鲁和部下认定为唯一的王后人选。历经凯鲁登基为王、放弃回日本、多次被掳、流产以及政治斗争之后，娜姬雅终于自王宫中被排除，由夕梨登上后位继承达瓦安娜的名号，与凯鲁两人共同创造盛世。
