贤俊（李秉宪 饰）和思宇（郑俊浩 饰）为NSS（国家安全局）要员，均爱上了美丽上司胜熙（金泰熙 饰），但后者与贤俊情投意合。副局长白山派他们营救科学家，后者死前将一U盘托付贤俊。白山密派贤俊暗杀朝鲜2号人物，贤俊不辱使命，却遭灭口，出于兄弟情，思宇放了贤俊。后者准备与胜熙逃亡时遭遇爆炸。贤俊逃亡日本，并与追踪他的朝鲜特工善华（金素妍 饰）冰释前嫌，共同进退。死里逃生的胜熙坚信贤俊在世，多次违规调查。贤俊在日本遭到追杀，连累救命恩人一家惨死。走投无路的贤俊投靠了朝鲜，并随恐怖组织攻击了NSS总部，见到了朝思暮想的胜熙，但仍无法相认。贤俊终于解开了U盘的秘密，原来白山是自己的杀父仇人，而这背后还隐藏着一个神秘组织——IRIS。朝韩双方高层会谈，卫队长密谋制造恐怖爆炸。追查中的胜熙被恐怖分子生擒，爱人竟以仇人面目相对，迎接他们的是更加残酷的阴谋……
这夜，渭州一家大宅院里，一名披头散发的女子从被窝里爬起来，手中握着染血的短刀，屋主刁四虎已血溅当场......另一夜，广州首富许建欲将一名女子推倒床上，却发现死神已在向他招手......池州富商周琦这夜娶妾，翌日却被发现遭乱刀杀死.....包拯（金超群 饰）正自沉吟。他出巡池州，遇上周琦一案，调查间竟发现案中有案——三名死者似并不相识，但都死于新婚之夜，而血案发生后新娘子均无所踪。更奇怪的是，死者都是富商，性好女色，全死于卧房，且致命原因并非刀伤，而是中了黑寡妇蜘蛛毒毙命。包拯到广州省亲，并着手调查毒蜘蛛案，发现三名死者原是扬州结拜兄弟，而当地首富收发巴人杰（陆一龙 饰）、巴人凤（杨仲恩 饰），亦是一伙，巴氏兄弟更勾结知府师崔禄（午马 饰），阻挠调查。此时广州万花楼新来了一名色艺双全的名妓海棠（甄秀珍 饰），引得好色的巴人杰垂涎。这天海棠偕侍女秋儿遭人当街调戏，幸得展昭（焦恩俊 饰）解围，展护卫被冷艳的海棠迷倒，稍后方知对方原为青楼名妓。难解相思之苦的展大侠向海棠提亲，奈何伊人早将女儿私情置之度外，不惜以鲜血饲养毒蜘蛛，为十二年前的一桩悬案报仇......
《奇妙之城》通过国内外六个城市中的人物故事展示城市的奇妙之处，深度挖掘人与城市的关系。
